 | ||
Toomkirik ehitati 13.–16. sajandil kolmelöövilise basiilikana, mille pikihoone külgedele lisati kabelilöövid. 15. sajandi lõpuks valmisid kiriku lääneküljel kaks torni.
16. sajandi luterliku reformatsiooniga kaasnenud pildirüüste tagajärjel sai hoone kahjustada ja muutus Liivi sõja ajal ajapikku varemeiks.
Seoses ülikooli taasavamisega 1802. aastal rekonstrueeriti kiriku kooriosa aastail 1804–1806 ülikooli raamatukogu tarbeks.
Pärast ülikooli raamatukogu kolimist uude majja 1981. aastal sai hoone valdajaks ülikooli ajaloo muuseum.
1985.–1988. aastatel toimunud restaureerimistööd andsid hoone sisekujundusele praeguse ilme – kunagise kiriku lõuna- ja põhjaküljele ehitati kaks uut trepikoda, avati keskaegsed petikud, saalides taastati osaliselt 19. sajandi interjöör.
2001. aastal alustasid Tartu Ülikool, Tartu linn ja riiklik muinsuskaitse toomkiriku varemete konserveerimist. 2005. aastaks renoveeriti ning avati külastajatele tornide säilinud osa, mille tipus asuvad ümbruskonnale kaunist vaadet pakkuvad vaateplatvormid. Tornid on külastajatele avatud aprillist novembrini.